• 规格：20μl质粒
• 启动子：CAG
• 复制子：pUC
• 原核抗性：氨苄青霉素Amp
• 筛选标记：遗传霉素G418
• 克隆菌株：大肠杆菌Stbl3
• 质粒简介：         Ai9是一个哺乳细胞红色荧光蛋白表达质粒。
• 质粒图谱1： png/1-1G226110024T2.png

质粒序列： 点击查看序列

LOCUS       Exported               17251 bp ds-DNA     circular SYN 26-DEC-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..17251

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     protein_bind    1245..1278

                     /label=FRT (minimal)

                     /bound_moiety="FLP recombinase from the Saccharomyces 

                     cerevisiae 2u plasmid"

                     /note="supports FLP-mediated excision but not integration 

                     (Turan and Bode, 2011)"

     protein_bind    complement(1302..1335)

                     /label=loxP

                     /bound_moiety="Cre recombinase"

                     /note="Cre-mediated recombination occurs in the 8-bp core 

                     sequence (GCATACAT)."

     polyA_signal    1502..1636

                     /label=SV40 poly(A) signal

                     /note="SV40 polyadenylation signal"

     polyA_signal    1756..1890

                     /label=SV40 poly(A) signal

                     /note="SV40 polyadenylation signal"

     protein_bind    complement(1919..1952)

                     /label=loxP

                     /bound_moiety="Cre recombinase"

                     /note="Cre-mediated recombination occurs in the 8-bp core 

                     sequence (GCATACAT)."

     CDS             2033..3463

                     /codon_start=1

                     /product="tandem dimeric (pseudo-monomeric) derivative of 

                     DsRed (Shaner et al., 2004)"

                     /label=tdTomato

                     /note="mammalian codon-optimized"

                     /translation="MVSKGEEVIKEFMRFKVRMEGSMNGHEFEIEGEGEGRPYEGTQTA

                     KLKVTKGGPLPFAWDILSPQFMYGSKAYVKHPADIPDYKKLSFPEGFKWERVMNFEDGG

                     LVTVTQDSSLQDGTLIYKVKMRGTNFPPDGPVMQKKTMGWEASTERLYPRDGVLKGEIH

                     QALKLKDGGHYLVEFKTIYMAKKPVQLPGYYYVDTKLDITSHNEDYTIVEQYERSEGRH

                     HLFLGHGTGSTGSGSSGTASSEDNNMAVIKEFMRFKVRMEGSMNGHEFEIEGEGEGRPY

                     EGTQTAKLKVTKGGPLPFAWDILSPQFMYGSKAYVKHPADIPDYKKLSFPEGFKWERVM

                     NFEDGGLVTVTQDSSLQDGTLIYKVKMRGTNFPPDGPVMQKKTMGWEASTERLYPRDGV

                     LKGEIHQALKLKDGGHYLVEFKTIYMAKKPVQLPGYYYVDTKLDITSHNEDYTIVEQYE

                     RSEGRHHLFLYGMDELYK"

     misc_feature    3529..4117

                     /label=WPRE

                     /note="woodchuck hepatitis virus posttranscriptional 

                     regulatory element"

     polyA_signal    4144..4351

                     /label=bGH poly(A) signal

                     /note="bovine growth hormone polyadenylation signal"

     protein_bind    4359..4392

                     /label=attB

                     /bound_moiety="phage phi-C31 integrase"

                     /note="minimal attB site for the phi-C31 integrase (Groth 

                     et al., 2000)"

     promoter        4414..4913

                     /label=PGK promoter

                     /note="mouse phosphoglycerate kinase 1 promoter"

     protein_bind    4933..4966

                     /label=FRT (minimal)

                     /bound_moiety="FLP recombinase from the Saccharomyces 

                     cerevisiae 2u plasmid"

                     /note="supports FLP-mediated excision but not integration 

                     (Turan and Bode, 2011)"

     CDS             4973..5776

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(3')-II (or nptII)"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"

                     /label=NeoR/KanR

                     /note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418 

                     (Geneticin(R))"

                     /translation="MGSAIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQ

                     GRPVLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQD

                     LLSSHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPATCPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDE

                     EHQGLAPAELFARLKARMPDGDDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQ

                     DIALATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"

     polyA_signal    5786..6247

                     /label=PGK poly(A) signal

                     /note="mouse phosphoglycerate kinase 1 polyadenylation 

                     signal"

     misc_feature    6313..10653

                     /label=Rosa26 right arm

                     /note="right homology arm from intron 1 of the mouse Rosa26

                     gene (Soriano, 1999)"

     promoter        10703..11202

                     /label=PGK promoter

                     /note="mouse phosphoglycerate kinase 1 promoter"

     CDS             11229..11801

                     /codon_start=1

                     /gene="Corynebacterium diphtheriae tox"

                     /product="diphtheria toxin fragment A"

                     /label=DTA

                     /translation="DDVVDSSKSFVMENFSSYHGTKPGYVDSIQKGIQKPKSGTQGNYD

                     DDWKGFYSTDNKYDAAGYSVDNENPLSGKAGGVVKVTYPGLTKVLALKVDNAETIKKEL

                     GLSLTEPLMEQVGTEEFIKRFGDGASRVVLSLPFAEGSSSVEYINNWEQAKALSVELEI

                     NFETRGKRGQDAMYEYMAQACAGNRVRR"

     intron          11878..11943

                     /label=small t intron

                     /note="SV40 (simian virus 40) small t antigen intron"

     polyA_signal    12017..12241

                     /label=bGH poly(A) signal

                     /note="bovine growth hormone polyadenylation signal"

     rep_origin      complement(12744..13332)

                     /direction=LEFT

                     /label=ori

                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 

                     replication"

     CDS             complement(13503..14363)

                     /codon_start=1

                     /gene="bla"

                     /product="beta-lactamase"

                     /label=AmpR

                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and

                     related antibiotics"

                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI

                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS

                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW

                     EPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA

                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS

                     LIKHW"

     promoter        complement(14364..14468)

                     /gene="bla"

                     /label=AmpR promoter

     rep_origin      14495..14950

                     /direction=RIGHT

                     /label=f1 ori

                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow 

                     indicates direction of (+) strand synthesis"

     misc_feature    15932..16725

                     /label=Rosa26 left arm

                     /note="left homology arm from intron 1 of the mouse Rosa26 

                     gene (Soriano, 1999)"

     misc_feature    16821..1169

                     /label=CAG promoter

ORIGIN

        1 cgccgggcgg ggcggggcgg ggcgaggggc ggggcggggc gaggcggaga ggtgcggcgg

       61 cagccaatca gagcggcgcg ctccgaaagt ttccttttat ggcgaggcgg cggcggcggc

      121 ggccctataa aaagcgaagc gcgcggcggg cgggagtcgc tgcgcgctgc cttcgccccg

      181 tgccccgctc cgccgccgcc tcgcgccgcc cgccccggct ctgactgacc gcgttactcc

      241 cacaggtgag cgggcgggac ggcccttctc ctccgggctg taattagcgc ttggtttaat

      301 gacggcttgt ttcttttctg tggctgcgtg aaagccttga ggggctccgg gagggccctt

      361 tgtgcggggg gagcggctcg gggggtgcgt gcgtgtgtgt gtgcgtgggg agcgccgcgt

      421 gcggctccgc gctgcccggc ggctgtgagc gctgcgggcg cggcgcgggg ctttgtgcgc

      481 tccgcagtgt gcgcgagggg agcgcggccg ggggcggtgc cccgcggtgc ggggggggct

      541 gcgaggggaa caaaggctgc gtgcggggtg tgtgcgtggg ggggtgagca gggggtgtgg

      601 gcgcgtcggt cgggctgcaa ccccccctgc acccccctcc ccgagttgct gagcacggcc

      661 cggcttcggg tgcggggctc cgtacggggc gtggcgcggg gctcgccgtg ccgggcgggg

      721 ggtggcggca ggtgggggtg ccgggcgggg cggggccgcc tcgggccggg gagggctcgg

      781 gggaggggcg cggcggcccc cggagcgccg gcggctgtcg aggcgcggcg agccgcagcc