• 规格：20μl质粒
• 质粒图谱1： png/1-1F92Q446119C.png

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LOCUS       Exported                7905 bp ds-DNA     circular SYN 17-JAN-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

ACCESSION   .

VERSION     .

KEYWORDS    .

SOURCE      synthetic DNA construct

  ORGANISM  synthetic DNA construct

REFERENCE   1  (bases 1 to 7905)

  AUTHORS   .

  TITLE     Direct Submission

  JOURNAL   Exported Sep 28, 2017 from MiaoLingPlasmid

            http://www.fenghbio.cn

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..7905

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     rep_origin      12..467

                     /direction=RIGHT

                     /label=f1 ori

                     /note="f1 bacteriophage origin of replication; arrow 

                     indicates direction of (+) strand synthesis"

     CDS             complement(560..1375)

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(3')-Ia"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=KanR

                     /note="confers resistance to kanamycin in bacteria or G418 

                     (Geneticin(R)) in eukaryotes"

                     /translation="MSHIQRETSCSRPRLNSNMDADLYGYKWARDNVGQSGATIYRLYG

                     KPDAPELFLKHGKGSVANDVTDEMVRLNWLTEFMPLPTIKHFIRTPDDAWLLTTAIPGK

                     TAFQVLEEYPDSGENIVDALAVFLRRLHSIPVCNCPFNSDRVFRLAQAQSRMNNGLVDA

                     SDFDDERNGWPVEQVWKEMHKLLPFSPDSVVTHGDFSLDNLIFDEGKLIGCIDVGRVGI

                     ADRYQDLAILWNCLGEFSPSLQKRLFQKYGIDNPDMNKLQFHLMLDEFF"

     rep_origin      1497..2085

                     /direction=RIGHT

                     /label=ori

                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 

                     replication"

     misc_feature    2271..2413

                     /label=bom

                     /note="basis of mobility region from pBR322"

     CDS             complement(2515..2706)

                     /codon_start=1

                     /gene="rop"

                     /product="Rop protein, which maintains plasmids at low copy

                     number"

                     /label=rop

                     /translation="MTKQEKTALNMARFIRSQTLTLLEKLNELDADEQADICESLHDHA

                     DELYRSCLARFGDDGENL"

     CDS             complement(3507..4124)

                     /codon_start=1

                     /label=FixJ

                     /translation="MTTKGHIYVIDDDAAMRDSLNFLLDSAGFGVTLFDDAQAFLDALP

                     GLSFGCVVSDVRMPGLDGIELLKRMKAQQSPFPILIMTGHGDVPLAVEAMKLGAVDFLE

                     KPFEDDRLTAMIESAIRQAEPAAKSEAVAQDIAARVASLSPRERQVMEGLIAGLSNKLI

                     AREYDISPRTIEVYRANVMTKMQANSLSELVRLAMRAGMLND"

     misc_feature    complement(3507..4124)

                     /label=FixJ

     misc_feature    complement(3507..4124)

                     /label=FixJ

                     /note="YF1/FixJ bicistronic operon"

     misc_feature    3510..5263

                     /label=YF1/FixJ

                     /note="bicistronic operon"

     misc_feature    complement(4121..5263)

                     /label=YF1

                     /note="YF1/FixJ bicistronic operon"

     promoter        complement(5264..5341)

                     /gene="lacI (mutant)"

                     /label=lacIq promoter

                     /note="In the lacIq allele, a single base change in the 

                     promoter boosts expression of the lacI gene about 10-fold."

     misc_feature    5636..5882

                     /label=FixK2 promoter

     RBS             5889..5900

                     /note="strong bacterial ribosome binding site (Elowitz and 

                     Leibler, 2000)"

     CDS             5907..6617

                     /codon_start=1

                     /gene="cI"

                     /product="phage lambda repressor  

                     

                     cI-LVA"

                     /label=-lambda repressor

                     /translation="MSTKKKPLTQEQLEDARRLKAIYEKKKNELGLSQESVADKMGMGQ

                     SGVGALFNGINALNAYNAALLAKILKVSVEEFSPSIAREIYEMYEAVSMQPSLRSEYEY

                     PVFSHVQAGMFSPELRTFTKGDAERWVSTTKKASDSAFWLEVEGNSMTAPTGSKPSFPD

                     GMLILVDPEQAVEPGDFCIARLGGDEFTFKKLIRDSGQVFLQPLNPQYPMIPCNESCSV

                     VGKVIASQWPEETFG"

     terminator      6698..6769

                     /label=rrnB T1 terminator

                     /note="transcription terminator T1 from the E. coli rrnB 

                     gene"

     terminator      6785..6812

                     /label=T7Te terminator

                     /note="phage T7 early transcription terminator"

     misc_feature    6827..6875

                     /label=lambda pR promoter

                     /note="lambda pR promoter"

     RBS             6888..6910

                     /note="efficient ribosome binding site from bacteriophage 

                     T7 gene 10 (Olins and Rangwala, 1989)"

     CDS             6929..6946

                     /codon_start=1

                     /product="6xHis affinity tag"

                     /label=6xHis

                     /translation="HHHHHH"

     CDS             6956..6973

                     /codon_start=1

                     /product="thrombin recognition and cleavage site"

                     /label=thrombin site

                     /translation="LVPRGS"

     CDS             6977..7009

                     /codon_start=1

                     /product="leader peptide from bacteriophage T7 gene 10"

                     /label=T7 tag (gene 10 leader)

                     /note="promotes efficient translation in E. coli"

                     /translation="MASMTGGQQMG"

     CDS             7017..7727

                     /codon_start=1

                     /product="monomeric derivative of DsRed fluorescent protein

                     (Shaner et al., 2004)"

                     /label=mCherry

                     /note="mammalian codon-optimized"

                     /translation="MVSKGEEDNMAIIKEFMRFKVHMEGSVNGHEFEIEGEGEGRPYEG

                     TQTAKLKVTKGGPLPFAWDILSPQFMYGSKAYVKHPADIPDYLKLSFPEGFKWERVMNF

                     EDGGVVTVTQDSSLQDGEFIYKVKLRGTNFPSDGPVMQKKTMGWEASSERMYPEDGALK

                     GEIKQRLKLKDGGHYDAEVKTTYKAKKPVQLPGAYNVNIKLDITSHNEDYTIVEQYERA

                     EGRHSTGGMDELYK"

     CDS             7749..7766

                     /codon_start=1

                     /product="6xHis affinity tag"

                     /label=6xHis

                     /translation="HHHHHH"

     terminator      7833..7880

                     /label=T7 terminator

                     /note="transcription terminator for bacteriophage T7 RNA 

                     polymerase"

ORIGIN

        1 tggcgaatgg gacgcgccct gtagcggcgc attaagcgcg gcgggtgtgg tggttacgcg

       61 cagcgtgacc gctacacttg ccagcgccct agcgcccgct cctttcgctt tcttcccttc

      121 ctttctcgcc acgttcgccg gctttccccg tcaagctcta aatcgggggc tccctttagg

      181 gttccgattt agtgctttac ggcacctcga ccccaaaaaa cttgattagg gtgatggttc

      241 acgtagtggg ccatcgccct gatagacggt ttttcgccct ttgacgttgg agtccacgtt

      301 ctttaatagt ggactcttgt tccaaactgg aacaacactc aaccctatct cggtctattc

      361 ttttgattta taagggattt tgccgatttc ggcctattgg ttaaaaaatg agctgattta

      421 acaaaaattt aacgcgaatt ttaacaaaat attaacgttt acaatttcag gtggcacttt

      481 tcggggaaat gtgcgcggaa cccctatttg tttatttttc taaatacatt caaatatgta

      541 tccgctcatg aattaattct tagaaaaact catcgagcat caaatgaaac tgcaatttat

      601 tcatatcagg attatcaata ccatattttt gaaaaagccg tttctgtaat gaaggagaaa

      661 actcaccgag gcagttccat aggatggcaa gatcctggta tcggtctgcg attccgactc

      721 gtccaacatc aatacaacct attaatttcc cctcgtcaaa aataaggtta tcaagtgaga

      781 aatcaccatg agtgacgact gaatccggtg agaatggcaa aagtttatgc atttctttcc

      841 agacttgttc aacaggccag ccattacgct cgtcatcaaa atcactcgca tcaaccaaac