• 规格：20μl质粒
• 质粒图谱1： png/1-1F92GI035256.png

质粒序列： 点击查看序列

LOCUS       Exported                9542 bp ds-DNA     circular SYN 27-SEP-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

ACCESSION   .

VERSION     .

KEYWORDS    .

SOURCE      synthetic DNA construct

  ORGANISM  synthetic DNA construct

REFERENCE   1  (bases 1 to 9542)

  AUTHORS   .

  TITLE     Direct Submission

  JOURNAL   Exported Sep 27, 2017 from MiaoLingPlasmid

            http://www.fenghbio.cn

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..9542

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     misc_feature    278..417

                     /label=bom

                     /note="basis of mobility region from pBR322"

     rep_origin      complement(603..1191)

                     /direction=LEFT

                     /label=ori

                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 

                     replication"

     CDS             complement(1362..2222)

                     /codon_start=1

                     /gene="bla"

                     /product="beta-lactamase"

                     /label=AmpR

                     /note="confers resistance to ampicillin, carbenicillin, and

                     related antibiotics"

                     /translation="MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYI

                     ELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYS

                     PVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRW

                     EPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSA

                     LPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGAS

                     LIKHW"

     promoter        complement(2223..2327)

                     /gene="bla"

                     /label=AmpR promoter

     terminator      2643..2690

                     /label=T7 terminator

                     /note="transcription terminator for bacteriophage T7 RNA 

                     polymerase"

     CDS             complement(2751..6209)

                     /codon_start=1

                     /label=LwCas13a

                     /translation="MKVTKVDGISHKKYIEEGKLVKSTSEENRTSERLSELLSIRLDIY

                     IKNPDNASEEENRIRRENLKKFFSNKVLHLKDSVLYLKNRKEKNAVQDKNYSEEDISEY

                     DLKNKNSFSVLKKILLNEDVNSEELEIFRKDVEAKLNKINSLKYSFEENKANYQKINEN

                     NVEKVGGKSKRNIIYDYYRESAKRNDYINNVQEAFDKLYKKEDIEKLFFLIENSKKHEK

                     YKIREYYHKIIGRKNDKENFAKIIYEEIQNVNNIKELIEKIPDMSELKKSQVFYKYYLD

                     KEELNDKNIKYAFCHFVEIEMSQLLKNYVYKRLSNISNDKIKRIFEYQNLKKLIENKLL

                     NKLDTYVRNCGKYNYYLQVGEIATSDFIARNRQNEAFLRNIIGVSSVAYFSLRNILETE

                     NENDITGRMRGKTVKNNKGEEKYVSGEVDKIYNENKQNEVKENLKMFYSYDFNMDNKNE

                     IEDFFANIDEAISSIRHGIVHFNLELEGKDIFAFKNIAPSEISKKMFQNEINEKKLKLK

                     IFKQLNSANVFNYYEKDVIIKYLKNTKFNFVNKNIPFVPSFTKLYNKIEDLRNTLKFFW

                     SVPKDKEEKDAQIYLLKNIYYGEFLNKFVKNSKVFFKITNEVIKINKQRNQKTGHYKYQ

                     KFENIEKTVPVEYLAIIQSREMINNQDKEEKNTYIDFIQQIFLKGFIDYLNKNNLKYIE

                     SNNNNDNNDIFSKIKIKKDNKEKYDKILKNYEKHNRNKEIPHEINEFVREIKLGKILKY

                     TENLNMFYLILKLLNHKELTNLKGSLEKYQSANKEETFSDELELINLLNLDNNRVTEDF

                     ELEANEIGKFLDFNENKIKDRKELKKFDTNKIYFDGENIIKHRAFYNIKKYGMLNLLEK

                     IADKAKYKISLKELKEYSNKKNEIEKNYTMQQNLHRKYARPKKDEKFNDEDYKEYEKAI

                     GNIQKYTHLKNKVEFNELNLLQGLLLKILHRLVGYTSIWERDLRFRLKGEFPENHYIEE

                     IFNFDNSKNVKYKSGQIVEKYINFYKELYKDNVEKRSIYSDKKVKKLKQEKKDLYIRNY

                     IAHFNYIPHAEISLLEVLENLRKLLSYDRKLKNAIMKSIVDILKEYGFVATFKIGADKK

                     IEIQTLESEKIVHLKNLKKKKLMTDRNSEELCELVKVMFEYKALE"

     CDS             complement(6216..6506)

                     /codon_start=1

                     /gene="S. cerevisiae SMT3 (truncated)"

                     /product="cleavable ubiquitin-like protein tag"

                     /label=SUMO

                     /translation="MSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPL

                     RRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIG"

     CDS             complement(6507..6530)

                     /codon_start=1

                     /product="peptide that binds Strep-Tactin(R), an engineered

                     form of streptavidin"

                     /label=Strep-Tag II

                     /translation="WSHPQFEK"

     CDS             complement(6567..6590)

                     /codon_start=1

                     /product="peptide that binds Strep-Tactin(R), an engineered

                     form of streptavidin"

                     /label=Strep-Tag II

                     /translation="WSHPQFEK"

     CDS             complement(6603..6620)

                     /codon_start=1

                     /product="thrombin recognition and cleavage site"

                     /label=thrombin site

                     /translation="LVPRGS"

     CDS             complement(6630..6647)

                     /codon_start=1

                     /product="6xHis affinity tag"

                     /label=6xHis

                     /translation="HHHHHH"

     RBS             6666..6688

                     /note="efficient ribosome binding site from bacteriophage 

                     T7 gene 10 (Olins and Rangwala, 1989)"

     protein_bind    6703..6727

                     /label=lac operator

                     /bound_moiety="lac repressor encoded by lacI"

                     /note="The lac repressor binds to the lac operator to 

                     inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be 

                     relieved by adding lactose or 

                     isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside (IPTG)."

     promoter        complement(6728..6746)

                     /label=T7 promoter

                     /note="promoter for bacteriophage T7 RNA polymerase"

     promoter        7055..7132

                     /gene="lacI"

                     /label=lacI promoter

     CDS             7133..8215

                     /codon_start=1

                     /gene="lacI"

                     /product="lac repressor"

                     /label=lacI

                     /note="The lac repressor binds to the lac operator to 

                     inhibit transcription in E. coli. This inhibition can be 

                     relieved by adding lactose or 

                     isopropyl-beta-D-thiogalactopyranoside (IPTG)."

                     /translation="MKPVTLYDVAEYAGVSYQTVSRVVNQASHVSAKTREKVEAAMAEL

                     NYIPNRVAQQLAGKQSLLIGVATSSLALHAPSQIVAAIKSRADQLGASVVVSMVERSGV

                     EACKAAVHNLLAQRVSGLIINYPLDDQDAIAVEAACTNVPALFLDVSDQTPINSIIFSH

                     EDGTRLGVEHLVALGHQQIALLAGPLSSVSARLRLAGWHKYLTRNQIQPIAEREGDWSA

                     MSGFQQTMQMLNEGIVPTAMLVANDQMALGAMRAITESGLRVGADISVVGYDDTEDSSC

                     YIPPLTTIKQDFRLLGQTSVDRLLQLSQGQAVKGNQLLPVSLVKRKTTLAPNTQTASPR

                     ALADSLMQLARQVSRLESGQ"

     CDS             9527..176

                     /codon_start=1

                     /gene="rop"

                     /product="Rop protein, which maintains plasmids at low copy

                     number"

                     /label=rop

                     /translation="MTKQEKTALNMARFIRSQTLTLLEKLNELDADEQADICESLHDHA

                     DELYRSCLARFGDDGENL"

ORIGIN

        1 aaaccgccct taacatggcc cgctttatca gaagccagac attaacgctt ctggagaaac

       61 tcaacgagct ggacgcggat gaacaggcag acatctgtga atcgcttcac gaccacgctg

      121 atgagcttta ccgcagctgc ctcgcgcgtt tcggtgatga cggtgaaaac ctctgacaca

      181 tgcagctccc ggagacggtc acagcttgtc tgtaagcgga tgccgggagc agacaagccc

      241 gtcagggcgc gtcagcgggt gttggcgggt gtcggggcgc agccatgacc cagtcacgta

      301 gcgatagcgg agtgtatact ggcttaacta tgcggcatca gagcagattg tactgagagt

      361 gcaccattgc ggtgtgaaat accgcacaga tgcgtaagga gaaaataccg catcaggcgc

      421 tcttccgctt cctcgctcac tgactcgctg cgctcggtcg ttcggctgcg gcgagcggta

      481 tcagctcact caaaggcggt aatacggtta tccacagaat caggggataa cgcaggaaag

      541 aacatgtgag caaaaggcca gcaaaaggcc aggaaccgta aaaaggccgc gttgctggcg

      601 tttttccata ggctccgccc ccctgacgag catcacaaaa atcgacgctc aagtcagagg

      661 tggcgaaacc cgacaggact ataaagatac caggcgtttc cccctggaag ctccctcgtg

      721 cgctctcctg ttccgaccct gccgcttacc