• 规格：20μl质粒
• 质粒图谱1： png/1-1F92FUH6354.png

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LOCUS       Exported               13917 bp ds-DNA     circular SYN 27-SEP-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

ACCESSION   .

VERSION     .

KEYWORDS    .

SOURCE      synthetic DNA construct

  ORGANISM  synthetic DNA construct

REFERENCE   1  (bases 1 to 13917)

  AUTHORS   .

  TITLE     Direct Submission

  JOURNAL   Exported Sep 27, 2017 from MiaoLingPlasmid

            http://www.fenghbio.cn

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..13917

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     CDS             complement(145..516)

                     /codon_start=1

                     /gene="traJ"

                     /product="oriT-recognizing protein"

                     /label=traJ

                     /translation="MADETKPTRKGSPPIKVYCLPDERRAIEEKAAAAGMSLSAYLLAV

                     GQGYKITGVVDYEHVRELARINGDLGRLGGLLKLWLTDDPRTARFGDATILALLAKIEE

                     KQDELGKVMMGVVRPRAEP"

     oriT            549..658

                     /note="incP origin of transfer"

     CDS             complement(1339..1989)

                     /codon_start=1

                     /gene="tetR"

                     /product="tetracycline resistance regulatory protein"

                     /label=TetR

                     /translation="MTKLQPNTVIRAALDLLNEVGVDGLTTRKLAERLGVQQPALYWHF

                     RNKRALLDALAEAMLAENHTHSVPRADDDWRSFLIGNARSFRQALLAYRDGARIHAGTR

                     PGAPQMETADAQLRFLCEAGFSAGDAVNALMTISYFTVGAVLEEQAGDSDAGERGGTVE

                     QAPLSPLLRAAIDAFDEAGPDAAFEQGLAVIVDGLAKRRLVVRNVEGPRKGDD"

     misc_feature    2454..2478

                     /label=RB T-DNA repeat

                     /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     promoter        2634..2817

                     /function="NOS promoter"

                     /label=NOS promoter

                     /note="nopaline synthase promoter"

     CDS             2838..3632

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(3')-II (or nptII)"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"

                     /label=neo

                     /note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418 

                     (Geneticin(R))"

                     /translation="MIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQGRP

                     VLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQDLLS

                     SHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPATCPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDEEHQ

                     GLAPAELFARLKARMPDGDDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQDIA

                     LATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"

     terminator      4022..4274

                     /label=NOS terminator

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     misc_feature    4950..4990

                     /label=MCS

     CDS             5004..6815

                     /codon_start=1

                     /gene="uidA (or gusA) from E. coli"

                     /product="beta-glucuronidase"

                     /label=GUS

                     /translation="MLRPVETPTREIKKLDGLWAFSLDRENCGIDQRWWESALQESRAI

                     AVPGSFNDQFADADIRNYAGNVWYQREVFIPKGWAGQRIVLRFDAVTHYGKVWVNNQEV

                     MEHQGGYTPFEADVTPYVIAGKSVRITVCVNNELNWQTIPPGMVITDENGKKKQSYFHD

                     FFNYAGIHRSVMLYTTPNTWVDDITVVTHVAQDCNHASVDWQVVANGDVSVELRDADQQ

                     VVATGQGTSGTLQVVNPHLWQPGEGYLYELCVTAKSQTECDIYPLRVGIRSVAVKGEQF

                     LINHKPFYFTGFGRHEDADLRGKGFDNVLMVHDHALMDWIGANSYRTSHYPYAEEMLDW

                     ADEHGIVVIDETAAVGFNLSLGIGFEAGNKPKELYSEEAVNGETQQAHLQAIKELIARD

                     KNHPSVVMWSIANEPDTRPQGAREYFAPLAEATRKLDPTRPITCVNVMFCDAHTDTISD

                     LFDVLCLNRYYGWYVQSGDLETAEKVLEKELLAWQEKLHQPIIITEYGVDTLAGLHSMY

                     TDMWSEEYQCAWLDMYHRVFDRVSAVVGEQVWNFADFATSQGILRVGGNKKGIFTRDRK

                     PKSAAFLLQKRWTGMNFGEKPQQGGKQ"

     terminator      6886..7138

                     /label=NOS terminator

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     misc_feature    7781..7805

                     /label=LB T-DNA repeat

                     /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     CDS             complement(9401..10549)

                     /codon_start=1

                     /product="trans-acting replication protein that binds to 

                     and activates oriV"

                     /label=trfA

                     /translation="MNRTFDRKAYRQELIDAGFSAEDAETIASRTVMRAPRETFQSVGS

                     MVQQATAKIERDSVQLAPPALPAPSAAVERSRRLEQEAAGLAKSMTIDTRGTMTTKKRK

                     TAGEDLAKQVSEAKQAALLKHTKQQIKEMQLSLFDIAPWPDTMRAMPNDTARSALFTTR

                     NKKIPREALQNKVIFHVNKDVKITYTGVELRADDDELVWQQVLEYAKRTPIGEPITFTF

                     YELCQDLGWSINGRYYTKAEECLSRLQATAMGFTSDRVGHLESVSLLHRFRVLDRGKKT

                     SRCQVLIDEEIVVLFAGDHYTKFIWEKYRKLSPTARRMFDYFSSHREPYPLKLETFRLM

                     CGSDSTRVKKWREQVGEACEELRGSGLVEHAWVNDDLVHCKR"

     CDS             complement(10848..11642)

                     /codon_start=1

                     /gene="aphA-3"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=KanR

                     /note="confers resistance to kanamycin"

                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM

                     TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED

                     EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT

                     PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA

                     FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

     mobile_element  11834..12601

                     /mobile_element_type="insertion sequence:IS1"

                     /note="prokaryotic transposable element"

     rep_origin      13224..18

                     /label=oriV

                     /note="incP origin of replication"

ORIGIN

        1 tgagcgtcgc aaaggcgctc ggtcttgcct tgctcgtcgg tgatgtactt caccagctcc

       61 gcgaagtcgc tcttcttgat ggagcgcatg gggacgtgct tggcaatcac gcgcaccccc

      121 cggccgtttt agcggctaaa aaagtcatgg ctctgccctc gggcggacca cgcccatcat

      181 gaccttgcca agctcgtcct gcttctcttc gatcttcgcc agcagggcga ggatcgtggc

      241 atcaccgaac cgcgccgtgc gcgggtcgtc ggtgagccag agtttcagca ggccgcccag

      301 gcggcccagg tcgccattga tgcgggccag ctcgcggacg tgctcatagt ccacgacgcc

      361 cgtgattttg tagccctggc cgacggccag caggtaggcc gacaggctca tgccggccgc

      421 cgccgccttt tcctcaatcg ctcttcgttc gtctggaagg cagtacacct tgataggtgg

      481 gctgcccttc ctggttggct tggtttcatc agccatccgc ttgccctcat ctgttacgcc

      541 ggcggtagcc ggccagcctc gcagagcagg attcccgttg agcaccgcca ggtgcgaata

      601 agggacagtg aagaaggaac acccgctcgc gggtgggcct acttcaccta tcctgcccgg

      661 ctgacgccgt tggatacacc aaggaaagtc tacacgaacc ctttggcaaa atcctgtata

      721 tcgtgcgaaa aaggatggat ataccgaaaa aatcgctata atgaccccga agcagggtta

      781 tgcagcggaa aagcgccacg cttcccgaag ggagaaaggc ggacaggtat ccggtaagcg

      841 gcagggtcgg aacaggagag cgcacgaggg agcttccagg gggaaacgcc tggtatcttt

      901 atagtcctgt cgggtttcgc cacctctgac ttgagcgtcg atttttgtga tgctcgtcag

      961 gggggcggag cctatggaaa aacgccagca acgcggcctt tttacggttc ctggcctttt

     1021 gctggccttt tgctcacatg ttctttcctg cgttatcccc tgattctgtg gataaccgta

     1081 ttaccgcctt tgagtgagct gataccgctc gccgcagccg aacgaccgag cgcagcgagt

     1141 cagtgagcga ggaagcggaa gagcgccaga aggccgccag agaggccgag cgcggccgtg

     1201 aggcttggac gctagggcag ggcatgaaaa agcccgtagc gggctgctac gggcgtctga

     1261 cgcggtggaa agggggaggg gatgttgtct acatggctct gctgtagtga gtgggttgcg

     1321 ctccggcagc ggtcctgatc aatcgtcacc ctttctcggt ccttcaacgt tcctgacaac

     1381 gagcctcctt ttcgccaatc catcgacaat caccgcgagt ccctgctcga acgctgcgtc

     1441 cggaccggct tcgtcgaagg cgtctatcgc ggcccgcaac agcggcgaga gcggagcctg

     1501 ttcaacggtg ccgccgcgct cgccggcatc gctgtcgccg gcctgctcct caagcacggc

     1561 cccaacagtg aagtagctga ttgtcatcag cgcattgacg gcgtccccgg ccgaaaaacc

     1621 cgcctcgcag aggaagcgaa gctgcgcgtc ggccgtttcc atctgcggtg cgcccggtcg

     1681 cgtgccggca tggatgcgcg cgccatcgcg gtaggcgagc agcgcctgcc tgaagctgcg

     1741 ggcattcccg atcagaaatg agcgccagtc gtcgtcggct ctcggcaccg aatgcgtatg

     1801 attctccgcc agcatggctt cggccagtgc gtcgagcagc gcccgcttgt tcctgaagtg

     1861 ccagtaaagc gccggctgct gaacccccaa ccgttccgcc agtttgcgtg tcgtcagacc

     1921 gtctacgccg acctcgttca acaggtccag ggcggcacgg atcactgtat tcggctgcaa

     1981 ctttgtcatg cttgacactt tatcactgat aaacataata tgtccaccaa cttatcagtg

     2041 ataaagaatc cgcgcgttca atcggaccag cggaggctgg tccggaggcc agacgtgaaa

     2101 cccaacatac ccctgatcgt aattctgagc actgtcgcgc tcgacgctgt cggcatcggc

     2161 ctgattatgc cggtgctgcc gggcctcctg cgcgatctgg ttcactcgaa cgacgtcacc

     2221 gcccactatg gcattctgct ggcgctgtat gcgttggtgc aatttgcctg cgcacctgtg

     2281 ctgggcgcgc tgtcggatcg tttcgggcgg cggccaatct tgctcgtctc gctggccggc

     2341 gccagatctg gggaaccctg tggttggcat gcacatacaa atggacgaac ggataaacct

     2401 tttcacgccc ttttaaatat ccgattattc taataaacgc tcttttctct taggtttacc