• 规格：20μl质粒
• 原核抗性：卡那霉素Kan
• 筛选标记：潮霉素Hyg
• 克隆菌株：大肠杆菌DB3.1
• 质粒简介：              pYPQ202是一个植物细胞Gateway系列表达质粒。
• 质粒图谱1： png/1-1G212100209431.png

质粒序列： 点击查看序列

LOCUS       Exported               12807 bp ds-DNA     circular SYN 12-DEC-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..12807

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     rep_origin      1125..1319

                     /label=pVS1 oriV

                     /note="origin of replication for the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

     misc_feature    1663..1803

                     /label=bom

                     /note="basis of mobility region from pBR322"

     rep_origin      complement(1989..2577)

                     /direction=LEFT

                     /label=ori

                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 

                     replication"

     CDS             complement(2664..3458)

                     /codon_start=1

                     /gene="aphA-3"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=KanR

                     /note="confers resistance to kanamycin"

                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM

                     TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED

                     EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT

                     PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA

                     FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

     misc_feature    5082..5106

                     /label=LB T-DNA repeat

                     /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     polyA_signal    5184..5358

                     /label=CaMV poly(A) signal

                     /note="cauliflower mosaic virus polyadenylation signal"

     CDS             complement(5399..6424)

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(4)-Ia"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from E. coli"

                     /label=HygR

                     /note="confers resistance to hygromycin"

                     /translation="MKKPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRG

                     YVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRSQGVTLQDLP

                     ETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQ

                     TVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMF

                     GDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDG

                     NFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAK

                     K"

     promoter        complement(6491..7167)

                     /label=CaMV 35S promoter (enhanced)

                     /note="cauliflower mosaic virus 35S promoter with a 

                     duplicated enhancer region"

     terminator      7489..7741

                     /label=NOS terminator

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     protein_bind    7805..7929

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR2

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     CDS             complement(7970..8275)

                     /codon_start=1

                     /gene="ccdB"

                     /product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"

                     /label=ccdB

                     /note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be 

                     propagated in standard E. coli strains."

                     /translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRMVIPLASARLLSDK

                     VPRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"

     CDS             complement(8595..9275)

                     /codon_start=1

                     /product="chloramphenicol acetyltransferase"

                     /label=Chl

                     /note="confers resistance to chloramphenicol"

                     /translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL

                     KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS

                     LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM

                     DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQAGRNLE

                     DPAY"

     promoter        complement(9329..9359)

                     /label=lac UV5 promoter

                     /note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"

     protein_bind    complement(9384..9508)

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR1

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     misc_feature    complement(9547..10181)

                     /label=AtUBQ10 promoter

     misc_feature    10410..10434

                     /label=RB T-DNA repeat

                     /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     CDS             11735..12364

                     /codon_start=1

                     /product="stability protein from the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

                     /label=pVS1 StaA

                     /translation="MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLAGADVLLVDSDPQGSAR

                     DWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKAIGRRDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFVLIP

                     VQPSPYDIWATADLVELVKQRIEVTDGRLQAAFVVSRAIKGTRIGGEVAEALAGYELPI

                     LESRITQRVSYPGTAAAGTTVLESEPEGDAAREVQALAAEIKSKLI"

ORIGIN

        1 ccatccggcc cggtacaaat cggcgcggcg ctgggtgatg acctggtgga gaagttgaag

       61 gccgcgcagg ccgcccagcg gcaacgcatc gaggcagaag cacgccccgg tgaatcgtgg

      121 caagcggccg ctgatcgaat ccgcaaagaa tcccggcaac cgccggcagc cggtgcgccg

      181 tcgattagga agccgcccaa gggcgacgag caaccagatt ttttcgttcc gatgctctat

      241 gacgtgggca cccgcgatag tcgcagcatc atggacgtgg ccgttttccg tctgtcgaag

      301 cgtgaccgac gagctggcga ggtgatccgc tacgagcttc cagacgggca cgtagaggtt

      361 tccgcagggc cggccggcat ggccagtgtg tgggattacg acctggtact gatggcggtt

      421 tcccatctaa ccgaatccat gaaccgatac cgggaaggga agggagacaa gcccggccgc

      481 gtgttccgtc cacacgttgc ggacgtactc aagttctgcc ggcgagccga tggcggaaag

      541 cagaaagacg acctggtaga aacctgcatt cggttaaaca ccacgcacgt tgccatgcag

      601 cgtacgaaga aggccaagaa cggccgcctg gtgacggtat ccgagggtga agccttgatt

      661 agccgctaca agatcgtaaa gagcgaaacc gggcggccgg agtacatcga gatcgagcta

      721 gctgattgga tgtaccgcga gatcacagaa ggcaagaacc cggacgtgct gacggttcac

      781 cccgattact ttttgatcga tcccggcatc ggccgttttc tctaccgcct ggcacgccgc

      841 gccgcaggca aggcagaagc cagatggttg ttcaagacga tctacgaacg cagtggcagc

      901 gccggagagt tcaagaagtt ctgtttcacc gtgcgcaagc tgatcgggtc aaatgacctg

      961 ccggagtacg atttgaagga ggaggcgggg caggctggcc cgatcctagt catgcgctac

     1021 cgcaacctga tcgagggcga agcatccgcc ggttcctaat gtacggagca gatgctaggg

     1081 caaattgccc tagcagggga aaaaggtcga aaaggtctct ttcctgtgga tagcacgtac

     1141 attgggaacc caaagccgta cattgggaac cggaacccgt acattgggaa cccaaagccg

     1201 tacattggga accggtcaca catgtaagtg actgatataa aagagaaaaa aggcgatttt

     1261 tccgcctaaa actctttaaa acttattaaa actcttaaaa cccgcctggc ctgtgcataa

     1321 ctgtctggcc agcgcacagc cgaagagctg caaaaagcgc ctacccttcg gtcgctgcgc

     1381 tccctacgcc ccgccgcttc gcgtcggcct atcgcggccg ctggccgctc aaaaatggct

     1441 ggcctacggc caggcaatct accagggcgc ggacaagccg cgccgtcgcc actcgaccgc

     1501 cggcgcccac atcaaggcac cctgcctcgc gcgtttcggt gatgacggtg aaaacctctg

     1561 acacatgcag ctcccggaga cggtcacagc ttgtctgtaa gcggatgccg ggagcagaca

     1621 agcccgtcag ggcgcgtcag cgggtgttgg cgggtgtcgg ggcgcagcca tgacccagtc

     1681 acgtagcgat agcggagtgt atactggctt aactatgcgg catcagagca gattgtactg

     1741 agagtgcacc atatgcggtg tgaaataccg cacagatgcg taaggagaaa ataccgcatc

     1801 aggcgctctt ccgcttcctc gctcactgac tcgctgcgct cggtcgttcg gctgcggcga

     1861 gcggtatcag ctcactcaaa ggcggtaata cggttatcca cagaatcagg ggataacgca

     1921 ggaaagaaca tgtgagcaaa aggccagcaa aaggccagga accgtaaaaa ggccgcgttg

     1981 ctggcgtttt tccataggct ccgcccccct gacgagcatc acaaaaatcg acgctcaagt

     2041 cagaggtggc gaaacccgac aggactataa agataccagg cgtttccccc tggaagctcc

     2101 ctcgtgcgct ctcctgttcc gaccctgccg cttaccggat acctgtccgc ctttctccct

     2161 tcgggaagcg tggcgctttc tcatagctca cgctgtaggt atctcagttc ggtgtaggtc

     2221 gttcgctcca agctgggctg tgtgcacgaa ccccccgttc agcccgaccg ctgcgcctta

     2281 tccggtaact atcgtcttga gtccaacccg gtaagacacg acttatcgcc actggcagca

     2341 gccactggta acaggattag cagagcgagg tatgtaggcg gtgctacaga gttcttgaag

     2401 tggtggccta actacggcta cactagaagg acagtatttg gtatctgcgc tctgctgaag

     2461 ccagttacct tcggaaaaag agttggtagc tcttgatccg gcaaacaaac caccgctggt

     2521 agcggtggtt tttttgtttg caagcagcag attacgcgca gaaaaaaagg atctcaagaa

     2581 gatcctttga tcttttctac ggggtctgac gctcagtgga acgaaaactc acgttaaggg

     2641 attttggtca tgcattctag gtactaaaac aattcatcca gtaaaatata atattttatt

     2701 ttctcccaat caggcttgat ccccagtaag tcaaaaaata gctcgacata ctgttcttcc

     2761 ccgatatcct ccctgatcga ccggacgcag aaggcaatgt cataccactt gtccgccctg

     2821 ccgcttctcc caagatcaat aaagccactt actttgccat ctttcacaaa gatgttgctg

     2881 tctcccaggt cgcc