• 规格：20μl质粒
• 原核抗性：卡那霉素Kan
• 筛选标记：潮霉素Hyg/遗传霉素G418
• 克隆菌株：大肠杆菌DB3.1
• 质粒简介：           pGWB11是一个植物表达质粒。
• 质粒图谱1： png/1-1P12511322c17.png

质粒序列： 点击查看序列

LOCUS       Exported               17260 bp ds-DNA     circular SYN 25-JAN-2018

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..17260

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     CDS             complement(145..516)

                     /codon_start=1

                     /gene="traJ"

                     /product="oriT-recognizing protein"

                     /label=traJ

                     /translation="MADETKPTRKGSPPIKVYCLPDERRAIEEKAAAAGMSLSAYLLAV

                     GQGYKITGVVDYEHVRELARINGDLGRLGGLLKLWLTDDPRTARFGDATILALLAKIEE

                     KQDELGKVMMGVVRPRAEP"

     oriT            549..658

                     /note="incP origin of transfer"

     misc_feature    2454..2478

                     /label=RB

                     /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     promoter        2634..2817

                     /function="NOS promoter"

                     /label=NOS

                     /note="nopaline synthase promoter"

     CDS             2838..3632

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(3')-II (or nptII)"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"

                     /label=Neo

                     /note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418 

                     (Geneticin(R))"

                     /translation="MIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQGRP

                     VLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQDLLS

                     SHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPATCPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDEEHQ

                     GLAPAELFARLKARMPDGDDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQDIA

                     LATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"

     terminator      4022..4274

                     /label=NOS

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     promoter        5461..5806

                     /label=35S

                     /note="strong constitutive promoter from cauliflower mosaic

                     virus"

     protein_bind    5828..5952

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR1

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     promoter        5989..6019

                     /label=lac UV5

                     /note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"

     CDS             6073..6732

                     /codon_start=1

                     /gene="cat"

                     /product="chloramphenicol acetyltransferase"

                     /label=Chl

                     /note="confers resistance to chloramphenicol"

                     /translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL

                     KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS

                     LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM

                     DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQGGA"

     CDS             7074..7379

                     /codon_start=1

                     /gene="ccdB"

                     /product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"

                     /label=ccdB

                     /note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be 

                     propagated in standard E. coli strains."

                     /translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRMVIPLASARLLSDK

                     VSRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"

     protein_bind    complement(7420..7544)

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR2

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     CDS             7555..7578

                     /codon_start=1

                     /product="FLAG(R) epitope tag, followed by an enterokinase 

                     cleavage site"

                     /label=FLAG

                     /translation="DYKDDDDK"

     terminator      7600..7852

                     /label=NOS

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     terminator      8281..8533

                     /label=NOS

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     CDS             complement(9001..10026)

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(4)-Ia"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from E. coli"

                     /label=Hyg

                     /note="confers resistance to hygromycin"

                     /translation="MKKPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRG

                     YVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLP

                     ETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQ

                     TVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMF

                     GDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDG

                     NFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAK

                     E"

     promoter        complement(10036..10380)

                     /label=35S

                     /note="strong constitutive promoter from cauliflower mosaic

                     virus"

     misc_feature    11124..11148

                     /label=LB

                     /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     CDS             complement(12744..13892)

                     /codon_start=1

                     /product="trans-acting replication protein that binds to 

                     and activates oriV"

                     /label=trfA

                     /translation="MNRTFDRKAYRQELIDAGFSAEDAETIASRTVMRAPRETFQSVGS

                     MVQQATAKIERDSVQLAPPALPAPSAAVERSRRLEQEAAGLAKSMTIDTRGTMTTKKRK

                     TAGEDLAKQVSEAKQAALLKHTKQQIKEMQLSLFDIAPWPDTMRAMPNDTARSALFTTR

                     NKKIPREALQNKVIFHVNKDVKITYTGVELRADDDELVWQQVLEYAKRTPIGEPITFTF

                     YELCQDLGWSINGRYYTKAEECLSRLQATAMGFTSDRVGHLESVSLLHRFRVLDRGKKT

                     SRCQVLIDEEIVVLFAGDHYTKFIWEKYRKLSPTARRMFDYFSSHREPYPLKLETFRLM

                     CGSDSTRVKKWREQVGEACEELRGSGLVEHAWVNDDLVHCKR"

     CDS             complement(14191..14985)

                     /codon_start=1

                     /gene="aphA-3"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=Kan

                     /note="confers resistance to kanamycin"

                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM

                     TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED

                     EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT

                     PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA

                     FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

     mobile_element  15177..15944

                     /mobile_element_type="insertion sequence:IS1"

                     /note="prokaryotic transposable element"

     rep_origin      16567..18

                     /label=oriV

                     /note="incP origin of replication"

ORIGIN

        1 tgagcgtcgc aaaggcgctc ggtcttgcct tgctcgtcgg tgatgtactt caccagctcc

       61 gcgaagtcgc tcttcttgat ggagcgcatg gggacgtgct tggcaatcac gcgcaccccc

      121 cggccgtttt agcggctaaa aaagtcatgg ctctgccctc gggcggacca cgcccatcat

      181 gaccttgcca agctcgtcct gcttctcttc gatcttcgcc agcagggcga ggatcgtggc

      241 atcaccgaac cgcgccgtgc gcgggtcgtc ggtgagccag agtttcagca ggccgcccag

      301 gcggcccagg tcgccattga tgcgggccag ctcgcggacg tgctcatagt ccacgacgcc

      361 cgtgattttg tagccctggc cgacggccag caggtaggcc gacaggctca tgccggccgc

      421 cgccgccttt tcctcaatcg ctcttcgttc gtctggaagg cagtacacct tgataggtgg

      481 gctgcccttc ctggttggct tggtttcatc agccatccgc ttgccctcat ctgttacgcc

      541 ggcggtagcc ggccagcctc gcagagcagg attcccgttg agcaccgcca ggtgcgaata

      601 agggacagtg aagaaggaac acccgctcgc gggtgggcct acttcaccta tcctgcccgg

      661 ctgacgccgt tggatacacc aaggaaagtc tacacgaacc ctttggcaaa atcctgtata