• 规格：20μl质粒
• 质粒图谱1： png/1-1F92420024c03.png

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LOCUS       Exported               12188 bp ds-DNA     circular SYN 24-SEP-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

ACCESSION   .

VERSION     .

KEYWORDS    .

SOURCE      synthetic DNA construct

  ORGANISM  synthetic DNA construct

REFERENCE   1  (bases 1 to 12188)

  AUTHORS   .

  TITLE     Direct Submission

  JOURNAL   Exported Sep 24, 2017 from MiaoLingPlasmid

            http://www.fenghbio.cn

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..12188

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     misc_feature    1..25

                     /label=LB T-DNA repeat

                     /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     terminator      111..363

                     /label=MAS terminator

                     /note="mannopine synthase terminator"

     CDS             complement(373..924)

                     /codon_start=1

                     /gene="Streptomyces hygroscopicus bar"

                     /product="phosphinothricin acetyltransferase"

                     /label=Bar

                     /note="confers resistance to bialophos or phosphinothricin"

                     /translation="MSPERRPADIRRATEADMPAVCTIVNHYIETSTVNFRTEPQEPQE

                     WTDDLVRLRERYPWLVAEVDGEVAGIAYAGPWKARNAYDWTAESTVYVSPRHQRTGLGS

                     TLYTHLLKSLEAQGFKSVVAVIGLPNDPSVRMHEALGYAPRGMLRAAGFKHGNWHDVGF

                     WQLDFSLPVPPRPVLPVTEI"

     promoter        complement(930..1310)

                     /label=MAS promoter

                     /note="mannopine synthase promoter (Velten et al., 1984)"

     promoter        2306..2651

                     /label=CaMV 35S promoter

                     /note="strong constitutive promoter from cauliflower mosaic

                     virus"

     protein_bind    2663..2787

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR1

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     promoter        2812..2842

                     /label=lac UV5 promoter

                     /note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"

     CDS             2896..3555

                     /codon_start=1

                     /gene="cat"

                     /product="chloramphenicol acetyltransferase"

                     /label=CmR

                     /note="confers resistance to chloramphenicol"

                     /translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL

                     KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS

                     LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM

                     DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQGGA"

     CDS             3897..4202

                     /codon_start=1

                     /gene="ccdB"

                     /product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"

                     /label=ccdB

                     /note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be 

                     propagated in standard E. coli strains."

                     /translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRMVIPLASARLLSDK

                     VSRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"

     protein_bind    complement(4243..4367)

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR2

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     CDS             4381..4458

                     /codon_start=1

                     /product="calmodulin-binding peptide"

                     /label=CBP

                     /note="derived from skeletal muscle myosin light chain 

                     kinase; binds calmodulin with nanomolar affinity in the 

                     presence of calcium"

                     /translation="KRRWKKNFIAVSAANRFKKISSSGAL"

     CDS             4486..4506

                     /codon_start=1

                     /product="tobacco etch virus (TEV) protease recognition and

                     cleavage site"

                     /label=TEV site

                     /translation="ENLYFQG"

     CDS             4546..4719

                     /codon_start=1

                     /product="IgG-binding unit of Staphylococcus aureus protein

                     A"

                     /label=ProtA

                     /translation="VDNKFNKEQQNAFYEILHLPNLNEEQRNAFIQSLKDDPSQSANLL

                     AEAKKLNDAQAPK"

     CDS             4723..4893

                     /codon_start=1

                     /product="IgG-binding unit of Staphylococcus aureus protein

                     A"

                     /label=ProtA

                     /translation="DNKFNKEQQNAFYEILHLPNLNEEQRNAFIQSLKDDPSQSANLLA

                     EAKKLNGAQAPK"

     terminator      4959..5666

                     /label=OCS terminator

                     /note="octopine synthase terminator"

     misc_feature    5910..5934

                     /label=RB T-DNA repeat

                     /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     CDS             7234..7863

                     /codon_start=1

                     /product="stability protein from the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

                     /label=pVS1 StaA

                     /translation="MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLAGADVLLVDSDPQGSAR

                     DWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKAIGRRDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFVLIP

                     VQPSPYDIWATADLVELVKQRIEVTDGRLQAAFVVSRAIKGTRIGGEVAEALAGYELPI

                     LESRITQRVSYPGTAAAGTTVLESEPEGDAAREVQALAAEIKSKLI"

     CDS             8292..9365

                     /codon_start=1

                     /product="replication protein from the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

                     /label=pVS1 RepA

                     /translation="MSGRKPSGPVQIGAALGDDLVEKLKAAQAAQRQRIEAEARPGESW

                     QAAADRIRKESRQPPAAGAPSIRKPPKGDEQPDFFVPMLYDVGTRDSRSIMDVAVFRLS

                     KRDRRAGEVIRYELPDGHVEVSAGPAGMASVWDYDLVLMAVSHLTESMNRYREGKGDKP

                     GRVFRPHVADVLKFCRRADGGKQKDDLVETCIRLNTTHVAMQRTKKAKNGRLVTVSEGE

                     ALISRYKIVKSETGRPEYIEIELADWMYREITEGKNPDVLTVHPDYFLIDPGIGRFLYR

                     LARRAAGKAEARWLFKTIYERSGSAGEFKKFCFTVRKLIGSNDLPEYDLKEEAGQAGPI

                     LVMRYRNLIEGEASAGS"

     rep_origin      9431..9625

                     /label=pVS1 oriV

                     /note="origin of replication for the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

     misc_feature    9969..10109

                     /label=bom

                     /note="basis of mobility region from pBR322"

     rep_origin      complement(10295..10883)

                     /direction=LEFT

                     /label=ori

                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 

                     replication"

     CDS             complement(10970..11764)

                     /codon_start=1

                     /gene="aphA-3"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=KanR

                     /note="confers resistance to kanamycin"

                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM

                     TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED

                     EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT

                     PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA

                     FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

ORIGIN