每个实验室都有各种各样的载体,每个实验阶段也在使用不同的载体。
那么,你对你使用的载体了解多少呢?
我随机采访了几个生物专业的硕士同学:
同学A(做大肠表达): GEX-4T-2载体,大肠表达载体,大小约为5 kb,抗性为Amp,带有GST标签,有BamHI以及EcoRI酶切位点.....
我:那...有看过图谱吗?
同学A:木有 (キ`゚Д゚´)!!
同学B(做酵母表达): pPICZα/A载体,毕赤酵母表达载体,大小约为3.5kb,抗性为Zeocin
同学C(做大肠表达):pET-28a(+),载体,大肠表达载体,大小约为5.4kb,抗性为Kana,6xHis标签
...然而,他们都没有看过载体图谱!
那么,我们今天就来讲讲载体图谱!
其实,在美露的眼里,载体是这样的:
比如,pET-28a(+)
首先它是大肠表达载体,大小为5369 bp,胞内表达目的基因
然后,我们对其元件进行一个个的分析:
复制子:ColE1/pMB1/pBR322/pUC ori——起始载体的复制;f1 ori——f1噬菌体复制子,显示正义链合成方向
KanR:编码氨基糖苷磷酸转移酶,在原核细胞中产生卡那霉素抗性,在真核细胞中产生遗传霉素筛选标记
Rop:编码ROP蛋白 ,使得质粒维持低拷贝水平
乳糖操纵子元件——lacI promoter+ lacI (启动阻遏蛋白的表达,是lac operator的抑制因子),lac operator(lac操纵基因,阻遏蛋白与之结合后抑制其后基因的表达,乳糖类似物IPTG可与阻遏蛋白结合从而失去对lac operator的控制,进而使得其后基因正常表达)
T7 promoter:受控于T7 RNA聚合酶的启动子,是当今大肠杆菌表达系统的主流。 强大的T7启动子完全专一受控于T7 RNA聚合酶,而高活性的T7 RNA聚合酶合成mRNA的速度比大肠杆菌RNA聚合酶快5倍,当二者同时存在时,宿主本身基因的转录竞争不过T7表达系统,几乎所有的细胞资源都用于表达目的蛋白。
6xHis(6xHis亲和标签):MCS区C端和 N端各有一个,编码6个连续的His,用来作为纯化目标蛋白的标签
throbin site:Thrombin蛋白酶切位点
T7 tag:提升翻译效率
MCS:多克隆位点区域
T7 terminator:受控于T7 RNA聚合酶的终止子
接下来是第二个载体
pPICZα/A
它是毕赤酵母表达载体,大小为3593 bp
整合型载体(将DNA整合到毕赤酵母基因组上以实现表达)
可将目的蛋白分泌到胞外
然后,它的元件:
ori:ColE1/pMB1/pBR322/pUC 复制子:起始载体的复制
AOX1 promoter:甲醇诱导型启动子,表明载体需要甲醇诱导才可表达
α-factor secretion signal:分泌信号肽,使得目的基因表达的蛋白分泌到胞外
MCS:多克隆位点
Myc:载体标签,有对应抗体,可用于做 western-blot杂交应用中。
6xHis:(6xHis亲和标签):MCS区C端和 N端各有一个,编码6个连续的His,用来作为纯化目标蛋白的标签
AOX1 terminator:转录终止子
TEF1 promoter:EF-1α启动子-在真核细胞中启动抗性结合蛋白的表达
EM7 promoter:细菌启动子-在原核细胞中启动抗性结合蛋白的表达
BleoR:Zeocin抗性基因
CYC1 terminator:转录终止子
当然,有时候并不需要你这么仔细的去分析载体
但是对于载体的基本元件还是要知悉的,比如载体启动子,抗性元件,多克隆位点,载体标签
当你看懂了这些元件后,你就会懂得:为什么这个载体是诱导型载体?为什么这个载体可以用XX标签纯化?等等
但是有很多小伙伴表示不会看载体图谱
那么美露就来分享一下多年以来的经验
1.准备工作:
确定了载体之后(点击图片放大就能看清楚啦):
好啦,今天关于载体的内容就到这里啦~
我是丰晖生物
分子技术支持——贾美露
这是我的第一篇文章,希望大家多多支持
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