• 规格：20μl质粒
• 原核抗性：卡那霉素Kan
• 筛选标记：潮霉素Hyg
• 克隆菌株：大肠杆菌DB3.1
• 质粒简介：           pYPQ203 (pMDC32-Ubi1)是一个植物细胞Gateway系统表达质粒。
• 质粒图谱1： png/1-1G2211520264b.png

质粒序列： 点击查看序列

LOCUS       Exported               14174 bp ds-DNA     circular SYN 27-NOV-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..14174

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     promoter        315..991

                     /label=CaMV 35S promoter (enhanced)

                     /note="cauliflower mosaic virus 35S promoter with a 

                     duplicated enhancer region"

     CDS             1058..2083

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(4)-Ia"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from E. coli"

                     /label=HygR

                     /note="confers resistance to hygromycin"

                     /translation="MKKPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRG

                     YVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRSQGVTLQDLP

                     ETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQ

                     TVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMF

                     GDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDG

                     NFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAK

                     K"

     polyA_signal    2124..2298

                     /label=CaMV poly(A) signal

                     /note="cauliflower mosaic virus polyadenylation signal"

     misc_feature    2376..2400

                     /label=LB T-DNA repeat

                     /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     CDS             4024..4818

                     /codon_start=1

                     /gene="aphA-3"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=KanR

                     /note="confers resistance to kanamycin"

                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM

                     TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED

                     EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT

                     PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA

                     FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

     rep_origin      4905..5493

                     /direction=RIGHT

                     /label=ori

                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 

                     replication"

     misc_feature    5679..5819

                     /label=bom

                     /note="basis of mobility region from pBR322"

     rep_origin      6163..6357

                     /label=pVS1 oriV

                     /note="origin of replication for the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

     CDS             complement(6423..7496)

                     /codon_start=1

                     /product="replication protein from the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

                     /label=pVS1 RepA

                     /translation="MSGRKPSGPVQIGAALGDDLVEKLKAAQAAQRQRIEAEARPGESW

                     QAAADRIRKESRQPPAAGAPSIRKPPKGDEQPDFFVPMLYDVGTRDSRSIMDVAVFRLS

                     KRDRRAGEVIRYELPDGHVEVSAGPAGMASVWDYDLVLMAVSHLTESMNRYREGKGDKP

                     GRVFRPHVADVLKFCRRADGGKQKDDLVETCIRLNTTHVAMQRTKKAKNGRLVTVSEGE

                     ALISRYKIVKSETGRPEYIEIELADWMYREITEGKNPDVLTVHPDYFLIDPGIGRFLYR

                     LARRAAGKAEARWLFKTIYERSGSAGEFKKFCFTVRKLIGSNDLPEYDLKEEAGQAGPI

                     LVMRYRNLIEGEASAGS"

     CDS             complement(7925..8554)

                     /codon_start=1

                     /product="stability protein from the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

                     /label=pVS1 StaA

                     /translation="MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLAGADVLLVDSDPQGSAR

                     DWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKAIGRRDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFVLIP

                     VQPSPYDIWATADLVELVKQRIEVTDGRLQAAFVVSRAIKGTRIGGEVAEALAGYELPI

                     LESRITQRVSYPGTAAAGTTVLESEPEGDAAREVQALAAEIKSKLI"

     misc_feature    9849..9873

                     /label=RB T-DNA repeat

                     /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     promoter        10108..12105

                     /label=Ubi promoter

                     /note="maize polyubiquitin gene promoter"

     protein_bind    12148..12272

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR1

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     promoter        12297..12327

                     /label=lac UV5 promoter

                     /note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"

     CDS             12381..13061

                     /codon_start=1

                     /product="chloramphenicol acetyltransferase"

                     /label=CmR

                     /note="confers resistance to chloramphenicol"

                     /translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL

                     KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS

                     LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM

                     DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQAGRNLE

                     DPAY"

     CDS             13381..13686

                     /codon_start=1

                     /gene="ccdB"

                     /product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"

                     /label=ccdB

                     /note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be 

                     propagated in standard E. coli strains."

                     /translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRMVIPLASARLLSDK

                     VPRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"

     protein_bind    complement(13727..13851)

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR2

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     terminator      13915..14167

                     /label=NOS terminator

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

ORIGIN

        1 cgtaatcatg tcatagctgt ttcctgtgtg aaattgttat ccgctcacaa ttccacacaa

       61 catacgagcc ggaagcataa agtgtaaagc ctggggtgcc taatgagtga gctaactcac

      121 attaattgcg ttgcgctcac tgcccgcttt ccagtcggga aacctgtcgt gccagctgca

      181 ttaatgaatc ggccaacgcg cggggagagg cggtttgcgt attggctaga gcagcttgcc

      241 aacatggtgg agcacgacac tctcgtctac tccaagaata tcaaagatac agtctcagaa

      301 gaccaaaggg ctattgagac ttttcaacaa agggtaatat cgggaaacct cctcggattc

      361 cattgcccag ctatctgtca cttcatcaaa aggacagtag aaaaggaagg tggcacctac

      421 aaatgccatc attgcgataa aggaaaggct atcgttcaag atgcctctgc cgacagtggt

      481 cccaaagatg gacccccacc cacgaggagc atcgtggaaa aagaagacgt tccaaccacg

      541 tcttcaaagc aagtggattg atgtgaacat ggtggagcac gacactctcg tctactccaa

      601 gaatatcaaa gatacagtct cagaagacca aagggctatt gagacttttc aacaaagggt

      661 aatatcggga aacctcctcg gattccattg cccagctatc tgtcacttca tcaaaaggac

      721 agtagaaaag gaaggtggca cctacaaatg ccatcattgc gataaaggaa aggctatcgt

      781 tcaagatgcc tctgccgaca gtggtcccaa agatggaccc ccacccacga ggagcatcgt

      841 ggaaaaagaa gacgttccaa ccacgtcttc aaagcaagtg gattgatgtg atatctccac

      901 tgacgtaagg gatgacgcac aatcccacta tccttcgcaa gacccttcct ctatataagg

      961 aagttcattt catttggaga ggacacgctg aaatcaccag tctctctcta caaatctatc

     1021 tctctcgagc tttcgcagat ccggggggca atgagatatg aaaaagcctg aactcaccgc

     1081 gacgtctgtc gagaagtttc tgatcgaaaa gttcgacagc gtctccgacc tgatgcagct

     1141 ctcggagggc gaagaatctc gtgctttcag cttcgatgta ggagggcgtg gatatgtcct

     1201 gcgggtaaat agctgcgccg atggtttcta caaagatcgt tatgtttatc ggcactttgc

     1261 atcggccgcg ctcccgattc cggaagtgct tgacattggg gagtttagcg agagcctgac

     1321 ctattgcatc tcccgccgtt cacagggtgt cacgttgcaa gacctgcctg aaaccgaact

     1381 gcccgctgtt ctacaaccgg tcgcggaggc tatggatgcg atcgctgcgg ccgatcttag

     1441 ccagacgagc gggttcggcc cattcggacc gcaaggaatc ggtcaataca ctacatggcg

     1501 tgatttcata tgcgcgattg ctgatcccca tgtgtatcac tggcaaactg tgatggacga

     1561 caccgtcagt gcgtccgtcg cgcaggctct cgatgagctg atgctttggg ccgaggactg

     1621 ccccgaagtc cggcacctcg tgcacgcgga tttcggctcc aacaatgtcc tgacggacaa

     1681 tggccgcata acagcggtca ttgactggag cgaggcgatg ttcggggatt cccaatacga

     1741 ggtcgccaac atcttcttct ggaggccgtg gttggcttgt atggagcagc agacgcgcta

     1801 cttcgagcgg aggcatccgg agcttgcagg atcgccacga ctccgggcgt atatgctccg

     1861 cattggtctt gaccaactct atcagagctt ggttgacggc aatttcgatg atgcagcttg

     1921 ggcgcagggt cgatgcgacg caatcgtccg atccggagcc gggactgtcg ggcgtacaca

     1981 aatcgcccgc agaagcgcgg ccgtctggac cgatggctgt gtagaagtac tcgccgatag