• 规格：20μl质粒
• 原核抗性：卡那霉素Kan
• 筛选标记：潮霉素Hyg，遗传霉素G418
• 克隆菌株：大肠杆菌DB3.1
• 质粒简介：              pGWB12是一个植物表达质粒。
• 质粒图谱1： png/1-1P12514243O05.png

质粒序列： 点击查看序列

LOCUS       Exported               17262 bp ds-DNA     circular SYN 25-JAN-2018

DEFINITION  synthetic circular DNA

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..17262

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     CDS             complement(145..516)

                     /codon_start=1

                     /gene="traJ"

                     /product="oriT-recognizing protein"

                     /label=traJ

                     /translation="MADETKPTRKGSPPIKVYCLPDERRAIEEKAAAAGMSLSAYLLAV

                     GQGYKITGVVDYEHVRELARINGDLGRLGGLLKLWLTDDPRTARFGDATILALLAKIEE

                     KQDELGKVMMGVVRPRAEP"

     oriT            549..658

                     /note="incP origin of transfer"

     CDS             complement(1339..1989)

                     /codon_start=1

                     /gene="tetR"

                     /product="tetracycline resistance regulatory protein"

                     /label=TetR

                     /translation="MTKLQPNTVIRAALDLLNEVGVDGLTTRKLAERLGVQQPALYWHF

                     RNKRALLDALAEAMLAENHTHSVPRADDDWRSFLIGNARSFRQALLAYRDGARIHAGTR

                     PGAPQMETADAQLRFLCEAGFSAGDAVNALMTISYFTVGAVLEEQAGDSDAGERGGTVE

                     QAPLSPLLRAAIDAFDEAGPDAAFEQGLAVIVDGLAKRRLVVRNVEGPRKGDD"

     misc_feature    2454..2478

                     /label=RB T-DNA repeat

                     /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     promoter        2634..2817

                     /function="NOS promoter"

                     /label=NOS promoter

                     /note="nopaline synthase promoter"

     CDS             2838..3632

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(3')-II (or nptII)"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from Tn5"

                     /label=NeoR/KanR

                     /note="confers resistance to neomycin, kanamycin, and G418 

                     (Geneticin(R))"

                     /translation="MIEQDGLHAGSPAAWVERLFGYDWAQQTIGCSDAAVFRLSAQGRP

                     VLFVKTDLSGALNELQDEAARLSWLATTGVPCAAVLDVVTEAGRDWLLLGEVPGQDLLS

                     SHLAPAEKVSIMADAMRRLHTLDPATCPFDHQAKHRIERARTRMEAGLVDQDDLDEEHQ

                     GLAPAELFARLKARMPDGDDLVVTHGDACLPNIMVENGRFSGFIDCGRLGVADRYQDIA

                     LATRDIAEELGGEWADRFLVLYGIAAPDSQRIAFYRLLDEFF"

     terminator      4022..4274

                     /label=NOS terminator

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     promoter        5461..5806

                     /label=CaMV 35S promoter

                     /note="strong constitutive promoter from cauliflower mosaic

                     virus"

     CDS             5827..5850

                     /codon_start=1

                     /product="FLAG(R) epitope tag, followed by an enterokinase 

                     cleavage site"

                     /label=FLAG

                     /translation="DYKDDDDK"

     protein_bind    5860..5984

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR1

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     promoter        6021..6051

                     /label=lac UV5 promoter

                     /note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"

     CDS             6105..6764

                     /codon_start=1

                     /gene="cat"

                     /product="chloramphenicol acetyltransferase"

                     /label=CmR

                     /note="confers resistance to chloramphenicol"

                     /translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL

                     KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS

                     LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM

                     DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQGGA"

     CDS             7106..7411

                     /codon_start=1

                     /gene="ccdB"

                     /product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"

                     /label=ccdB

                     /note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be 

                     propagated in standard E. coli strains."

                     /translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRMVIPLASARLLSDK

                     VSRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"

     protein_bind    complement(7452..7576)

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR2

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     terminator      7602..7854

                     /label=NOS terminator

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     terminator      8283..8535

                     /label=NOS terminator

                     /note="nopaline synthase terminator and poly(A) signal"

     CDS             complement(9003..10028)

                     /codon_start=1

                     /gene="aph(4)-Ia"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase from E. coli"

                     /label=HygR

                     /note="confers resistance to hygromycin"

                     /translation="MKKPELTATSVEKFLIEKFDSVSDLMQLSEGEESRAFSFDVGGRG

                     YVLRVNSCADGFYKDRYVYRHFASAALPIPEVLDIGEFSESLTYCISRRAQGVTLQDLP

                     ETELPAVLQPVAEAMDAIAAADLSQTSGFGPFGPQGIGQYTTWRDFICAIADPHVYHWQ

                     TVMDDTVSASVAQALDELMLWAEDCPEVRHLVHADFGSNNVLTDNGRITAVIDWSEAMF

                     GDSQYEVANIFFWRPWLACMEQQTRYFERRHPELAGSPRLRAYMLRIGLDQLYQSLVDG

                     NFDDAAWAQGRCDAIVRSGAGTVGRTQIARRSAAVWTDGCVEVLADSGNRRPSTRPRAK

                     E"

     promoter        complement(10038..10382)

                     /label=CaMV 35S promoter

                     /note="strong constitutive promoter from cauliflower mosaic

                     virus"

     misc_feature    11126..11150

                     /label=LB T-DNA repeat

                     /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     CDS             complement(12746..13894)

                     /codon_start=1

                     /product="trans-acting replication protein that binds to 

                     and activates oriV"

                     /label=trfA

                     /translation="MNRTFDRKAYRQELIDAGFSAEDAETIASRTVMRAPRETFQSVGS

                     MVQQATAKIERDSVQLAPPALPAPSAAVERSRRLEQEAAGLAKSMTIDTRGTMTTKKRK

                     TAGEDLAKQVSEAKQAALLKHTKQQIKEMQLSLFDIAPWPDTMRAMPNDTARSALFTTR

                     NKKIPREALQNKVIFHVNKDVKITYTGVELRADDDELVWQQVLEYAKRTPIGEPITFTF

                     YELCQDLGWSINGRYYTKAEECLSRLQATAMGFTSDRVGHLESVSLLHRFRVLDRGKKT

                     SRCQVLIDEEIVVLFAGDHYTKFIWEKYRKLSPTARRMFDYFSSHREPYPLKLETFRLM

                     CGSDSTRVKKWREQVGEACEELRGSGLVEHAWVNDDLVHCKR"

     CDS             complement(14193..14987)

                     /codon_start=1

                     /gene="aphA-3"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=KanR

                     /note="confers resistance to kanamycin"

                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM

                     TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED

                     EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT

                     PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA

                     FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

     mobile_element  15179..15946

                     /mobile_element_type="insertion sequence:IS1"

                     /note="prokaryotic transposable element"

     rep_origin      16569..18

                     /label=oriV

                     /note="incP origin of replication"

ORIGIN

        1 tgagcgtcgc aaaggcgctc ggtcttgcct tgctcgtcgg tgatgtactt caccagctcc