• 规格：20μl质粒
• 质粒图谱1： png/1-1F9241959552X.png

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LOCUS       Exported               10376 bp ds-DNA     circular SYN 24-SEP-2017

DEFINITION  synthetic circular DNA

ACCESSION   .

VERSION     .

KEYWORDS    .

SOURCE      synthetic DNA construct

  ORGANISM  synthetic DNA construct

REFERENCE   1  (bases 1 to 10376)

  AUTHORS   .

  TITLE     Direct Submission

  JOURNAL   Exported Sep 24, 2017 from MiaoLingPlasmid

            http://www.fenghbio.cn

FEATURES             Location/Qualifiers

     source          1..10376

                     /organism="synthetic DNA construct"

                     /mol_type="other DNA"

     misc_feature    3..27

                     /label=LB T-DNA repeat

                     /note="left border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     terminator      113..365

                     /label=MAS terminator

                     /note="mannopine synthase terminator"

     CDS             complement(375..926)

                     /codon_start=1

                     /gene="Streptomyces hygroscopicus bar"

                     /product="phosphinothricin acetyltransferase"

                     /label=Bar

                     /note="confers resistance to bialophos or phosphinothricin"

                     /translation="MSPERRPADIRRATEADMPAVCTIVNHYIETSTVNFRTEPQEPQE

                     WTDDLVRLRERYPWLVAEVDGEVAGIAYAGPWKARNAYDWTAESTVYVSPRHQRTGLGS

                     TLYTHLLKSLEAQGFKSVVAVIGLPNDPSVRMHEALGYAPRGMLRAAGFKHGNWHDVGF

                     WQLDFSLPVPPRPVLPVTEI"

     promoter        complement(932..1312)

                     /label=MAS promoter

                     /note="mannopine synthase promoter (Velten et al., 1984)"

     protein_bind    1364..1488

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR1

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     promoter        1513..1543

                     /label=lac UV5 promoter

                     /note="E. coli lac promoter with an ""up"" mutation"

     CDS             1597..2256

                     /codon_start=1

                     /gene="cat"

                     /product="chloramphenicol acetyltransferase"

                     /label=CmR

                     /note="confers resistance to chloramphenicol"

                     /translation="MEKKITGYTTVDISQWHRKEHFEAFQSVAQCTYNQTVQLDITAFL

                     KTVKKNKHKFYPAFIHILARLMNAHPEFRMAMKDGELVIWDSVHPCYTVFHEQTETFSS

                     LWSEYHDDFRQFLHIYSQDVACYGENLAYFPKGFIENMFFVSANPWVSFTSFDLNVANM

                     DNFFAPVFTMGKYYTQGDKVLMPLAIQVHHAVCDGFHVGRMLNELQQYCDEWQGGA"

     CDS             2598..2903

                     /codon_start=1

                     /gene="ccdB"

                     /product="CcdB, a bacterial toxin that poisons DNA gyrase"

                     /label=ccdB

                     /note="Plasmids containing the ccdB gene cannot be 

                     propagated in standard E. coli strains."

                     /translation="MQFKVYTYKRESRYRLFVDVQSDIIDTPGRRMVIPLASARLLSDK

                     VSRELYPVVHIGDESWRMMTTDMASVPVSVIGEEVADLSHRENDIKNAINLMFWGI"

     protein_bind    complement(2944..3068)

                     /gene="mutant version of attR"

                     /label=attR2

                     /bound_moiety="LR Clonase(TM)"

                     /note="recombination site for the Gateway(R) LR reaction"

     CDS             3070..3093

                     /codon_start=1

                     /product="FLAG(R) epitope tag, followed by an enterokinase 

                     cleavage site"

                     /label=FLAG

                     /translation="DYKDDDDK"

     terminator      3147..3854

                     /label=OCS terminator

                     /note="octopine synthase terminator"

     misc_feature    4098..4122

                     /label=RB T-DNA repeat

                     /note="right border repeat from nopaline C58 T-DNA"

     CDS             5422..6051

                     /codon_start=1

                     /product="stability protein from the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

                     /label=pVS1 StaA

                     /translation="MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLAGADVLLVDSDPQGSAR

                     DWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKAIGRRDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFVLIP

                     VQPSPYDIWATADLVELVKQRIEVTDGRLQAAFVVSRAIKGTRIGGEVAEALAGYELPI

                     LESRITQRVSYPGTAAAGTTVLESEPEGDAAREVQALAAEIKSKLI"

     CDS             6480..7553

                     /codon_start=1

                     /product="replication protein from the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

                     /label=pVS1 RepA

                     /translation="MSGRKPSGPVQIGAALGDDLVEKLKAAQAAQRQRIEAEARPGESW

                     QAAADRIRKESRQPPAAGAPSIRKPPKGDEQPDFFVPMLYDVGTRDSRSIMDVAVFRLS

                     KRDRRAGEVIRYELPDGHVEVSAGPAGMASVWDYDLVLMAVSHLTESMNRYREGKGDKP

                     GRVFRPHVADVLKFCRRADGGKQKDDLVETCIRLNTTHVAMQRTKKAKNGRLVTVSEGE

                     ALISRYKIVKSETGRPEYIEIELADWMYREITEGKNPDVLTVHPDYFLIDPGIGRFLYR

                     LARRAAGKAEARWLFKTIYERSGSAGEFKKFCFTVRKLIGSNDLPEYDLKEEAGQAGPI

                     LVMRYRNLIEGEASAGS"

     rep_origin      7619..7813

                     /label=pVS1 oriV

                     /note="origin of replication for the Pseudomonas plasmid 

                     pVS1 (Heeb et al., 2000)"

     misc_feature    8157..8297

                     /label=bom

                     /note="basis of mobility region from pBR322"

     rep_origin      complement(8483..9071)

                     /direction=LEFT

                     /label=ori

                     /note="high-copy-number ColE1/pMB1/pBR322/pUC origin of 

                     replication"

     CDS             complement(9158..9952)

                     /codon_start=1

                     /gene="aphA-3"

                     /product="aminoglycoside phosphotransferase"

                     /label=KanR

                     /note="confers resistance to kanamycin"

                     /translation="MAKMRISPELKKLIEKYRCVKDTEGMSPAKVYKLVGENENLYLKM

                     TDSRYKGTTYDVEREKDMMLWLEGKLPVPKVLHFERHDGWSNLLMSEADGVLCSEEYED

                     EQSPEKIIELYAECIRLFHSIDISDCPYTNSLDSRLAELDYLLNNDLADVDCENWEEDT

                     PFKDPRELYDFLKTEKPEEELVFSHGDLGDSNIFVKDGKVSGFIDLGRSGRADKWYDIA

                     FCVRSIREDIGEEQYVELFFDLLGIKPDWEKIKYYILLDELF"

ORIGIN

        1 gctggcagga tatattgtgg tgtaaacaaa ttgacgctta gacaacttaa taacacattg

       61 cggacgtttt taatgtactg aattaacgcc gaattaattc gagctcggat ctgataattt

      121 atttgaaaat tcataagaaa agcaaacgtt acatgaattg atgaaacaat acaaagacag

      181 ataaagccac gcacatttag gatattggcc gagattactg aatattgagt aagatcacgg

      241 aatttctgac aggagcatgt cttcaattca gcccaaatgg cagttgaaat actcaaaccg

      301 ccccatatgc aggagcggat cattcattgt ttgtttggtt gcctttgcca acatgggagt

      361 ccaagattct gcagtcaaat ctcggtgacg ggcaggaccg gacggggcgg taccggcagg

      421 ctgaagtcca gctgccagaa acccacgtca tgccagttcc cgtgcttgaa gccggccgcc

      481 cgcagcatgc cgcggggggc atatccgagc gcctcgtgca tgcgcacgct cgggtcgttg

      541 ggcagcccga tgacagcgac cacgctcttg aagccctgtg cctccaggga cttcagcagg

      601 tgggtgtaga gcgtggagcc cagtcccgtc cgctggtggc ggggggagac gtacacggtc

      661 gactcggccg tccagtcgta ggcgttgcgt gccttccagg ggcccgcgta ggcgatgccg

      721 gcgacctcgc cgtccacctc ggcgacgagc cagggatagc gctcccgcag acggacgagg

      781 tcgtccgtcc actcctgcgg ttcctgcggc tcggtacgga agttgaccgt gcttgtctcg

      841 atgtagtggt tgacgatggt gcagaccgcc ggcatgtccg cctcggtggc acggcggatg

      901 tcggccgggc gtcgttctgg gctcatcgat tcgatttggt gtatcgagat tggttatgaa

      961 attcagatgc tagtgtaatg tattggtaat ttgggaagat ataataggaa gcaaggctat

     1021 ttatccattt ctgaaaaggc gaaatggcgt caccgcgagc gtcacgcgca ttccgttctt

     1081 gctgtaaagc gttgtttggt acacttttga ctagcgaggc ttggcgtgtc agcgtatcta

     1141 ttcaaaagtc gttaatggct gcggatcaag aaaaagttgg aatagaaaca gaatacccgc

     1201 gaaattcagg cccggttgcc atgtcctaca cgccgaaata aacgaccaaa ttagtagaaa

     1261 aataaaaact gactcggata cttacgtcac gtcttgcgca ctgatttgaa aaatctcaga

     1321 attgaattct gcagtcgacg gtaccgcggg cccgggatca tcaacaagtt tgtacaaaaa

     1381 agctgaacga gaaacgtaaa atgatataaa tatcaatata ttaaattaga ttttgcataa

     1441 aaaacagact acataatact gtaaaacaca acatatccag tcatattggc ggccgcatta

     1501 ggcaccccag gctttacact ttatgcttcc ggctcgtata atgtgtggat tttgagttag

     1561 gatccgtcga gattttcagg agctaaggaa gctaaaatgg agaaaaaaat cactggatat

     1621 accaccgttg atatatccca atggcatcgt aaagaacatt ttgaggcatt tcagtcagtt